swanlab.Molecule
| 参数 | 描述 |
|---|---|
| pdb_data | (str) 接收的PDB数据（字符串形式） |
| caption | (str) 分子对象的标签。用于在实验看板中展示分子对象时进行标记。 |
简介
对各种类型的生物化学分子做转换，以被swanlab.log()记录。
从RDKit Mol对象创建
python
from rdkit import Chem
import swanlab
mol = Chem.MolFromSmiles("CCO")
molecule = swanlab.Molecule.from_mol(mol, caption="Ethanol")
swanlab.init(project="molecule_demo")
swanlab.log({"molecule": molecule})从PDB文件创建
python
import swanlab
molecule = swanlab.Molecule.from_pdb("path/to/your/pdb/file.pdb")
swanlab.init(project="molecule_demo")
swanlab.log({"molecule": molecule})从SDF文件创建
python
import swanlab
molecule = swanlab.Molecule.from_sdf("path/to/your/sdf/file.sdf")
swanlab.init(project="molecule_demo")
swanlab.log({"molecule": molecule})从SMILES字符串创建
python
import swanlab
molecule = swanlab.Molecule.from_smiles("CCO")
swanlab.init(project="molecule_demo")
swanlab.log({"molecule": molecule})从MOL文件创建
python
import swanlab
molecule = swanlab.Molecule.from_mol("path/to/your/mol/file.mol")
swanlab.init(project="molecule_demo")
swanlab.log({"molecule": molecule})